曾英削提督衔，贬为顺庆总兵，其部下于大海、李茂春也因诬陷反坐，贬为副将，文安之还趁机调整曾英兵马，给他编额战兵三千，辅兵一千零八十,镇守顺庆一府。
四川总督王应熊也被文安之记过一次，其督标也被削为三千，原提督王祥同样贬为总兵，而且是督标总兵，统领四川总督的三千标营，其部驻防播州。
这位原是王应熊家仆的猛将，十几岁时就能扛起几百斤的石墩子,能舞起百多斤大刀,号称小霸王，他年轻时被王应熊送去考了武生，后在四川为军，屡立战功，十分勇悍有名，王应熊当初能保遵义不失，就全凭这个旧仆。
弘光时曾授王祥挂征讨将军印，王祥勇悍，但也十分跋扈，完全把遵义当成私人地盘，之前就不怎么听经略之令。
这次文安之也是不客气的把他由提督降为总兵，还是王应熊的标兵，等于两人才剩下三千战兵兵额。
要知道，这王祥之前在遵义那就是个军阀，他到处招兵买马，甚至招募那些贼匪等，连摇黄贼土暴子都去招揽，他还给招来的这些贼匪、军头等授总兵、挂印,麾下号称三十六挂印总兵官。
挂印总兵在早前,那是只有公侯伯们才能担任的重臣大将，虽说明末时不值钱了，但那也是顶级武将名衔，结果王祥自己原是弘光朝的挂印总兵，现在自己私下任命了三十六个总兵，还俱挂印。
这事文安之当然知道，也屡次让他改过，但没当回事。
这次文安之直接就把王祥贬为总督标营总兵，他麾下的那些乱七八糟三十六挂印总兵，被文安之全部罢撤，要求解散归农。
紧接着，文安之也把樊一蘅斥责，记过，并将其督标削为三千，其麾下倚重的大将甘良臣贬去提督衔，降为督标总兵。侯天锡、屠龙、马应试，皆贬为副将。
忠勇镇总兵官秦翼明升四川提督，游击马万春升提标参将，兵额三千，驻宜宾。
原石柱总兵马万年改为忠勇镇总兵，兵额三千，驻石柱。
松潘副将朱化龙升为松潘总兵，兵额三千，驻松潘。
原云南提督杨展，调为统领五省经略提标营五千人马，驻奉节。
原忠孝军的曹勋升建昌镇总兵官，兵三千，驻建昌。
四川巡按御史兼五省监军御史张岱被文安之授为四川巡抚。
李乾德为云南巡抚。
范文光仍为贵州总督。
·······
原来川中有几大主要势力，分别是总督王应熊和王祥，他们驻遵义。
然后是巡抚马乾和总兵曾英、于大海、李茂春等，他们在川东一带。
还有总督樊一蘅，以及总兵甘良甘，副将侯天锡、屠龙、马应试等，另外还有如范文光、曹勋、杨展、谭弘谭诣谭文等部明军。
上次的整编，各部都没有怎么遵守，如王祥甚至公然私自任命了三十六挂印总兵等。
这次文安之决心借机大力整顿，把最不听话的巡抚马乾送去南京，然后削夺诸将的兵额，重划驻地。
王应熊、王祥诸部，总共保留三千兵马，驻遵守。
樊一蘅、甘良臣等也只保留三千兵马，驻地更是直接划到昆明，现在四川，属于客军。
马乾被踢出局后，曾英部削减为三千兵，驻防顺庆。
原范文光的部将刘道贞和黎神武，则都编为范文光的标营中，随他调去贵州。
贵州最大军头皮熊，这次也只给了三千兵额，与总督同驻贵阳。
原范文光大将曹勋，升授建昌总兵，杨展和朱化龙原来都是小军头，与王应熊樊一蘅马乾关系一般，之前也较尊奉文安之的命令。
这次也都升职，朱化龙升松潘镇总兵，杨展仍为提督衔，统经略标兵。
一番调整后。
四川实际保留了四镇省营，分别是松潘总兵朱化龙、建昌忠孝镇总兵曹勋、顺庆总兵曾英和石柱忠勇镇总兵马万年，皆是各三千兵。
然后秦翼明的四川提督标营，五千兵。
五省经略文安之的经标，五千，提督杨展统领，
总统秦良玉的统标，五千，总兵秦拱明统领。
四川总督王应熊督标三千，总兵王祥统领。
就剩下这些番号兵额。
樊一蘅是云南总督，甘良臣是他的督标总兵，他们的三千人在四川属于客军，同样范文光是贵州总督，刘道贞是他的督标总兵，黎神武是副将。
至于皮熊，是贵州提督，三千提标，也属于客军。
另外御营川贵行营五千，驻重庆，这不在地方军序列。
四川的省营一万二，加提标五千，总共才剩下一万七的战兵，以秦翼明为首。
经略、总督、巡抚们的标营，不在提督统领之列，但都在文安之指挥序列。