皮萨罗的态度惹恼了拜仁主席鲁梅尼格，在抛出了一句“任何球员想要得到与舍甫琴科同样多的薪水，就必须在开始阶段拿出比舍甫琴科更好的表现“后，拜仁于2007年5月20日官方宣布赛季结束后皮萨罗可以自由转会。
2007年5月19日是拜仁在06-07年赛季的最后一场联赛，皮萨罗取得了个人在德甲的第一百个进球，翌日拜仁便宣布皮萨罗将会离队。他01-07的六个赛季都是在拜仁慕尼黑度过的，在一百七十四场联赛中共进七十一个球，于2003、2005和2006年三次获得联赛和杯赛双冠王，于2001年赢得了国际足联洲际杯。
当年7月1日切尔西宣布与即将年满二十九岁的皮萨罗签约四年，时任切尔西主帅的穆里尼奥称赞皮萨罗有“英超前锋具备的优秀素质“，也对他的豪门经验大加赞赏。接过格雷米十四号球衣的皮萨罗很快打消了切尔西球迷对他的疑惑，在第一轮切尔西主场迎战伯明翰的比赛中就有进球。然而好景不长，随着切尔西炒掉主帅穆里尼奥，签下了法国前锋阿内尔卡，皮萨罗渐渐发现，从助理教练转正的格兰特已不再需要他，那个赛季他仅有二十一次出场，收获两粒进球。
2008年8月15日再距离欧洲转会窗关闭还有半个月的时候，皮萨罗的老东家不莱梅与切尔西达成一致，租借皮萨罗一个赛季。时隔七年后，秘鲁前锋再次回到了熟悉的威悉河畔，对不莱梅来说这是一笔双赢的买卖，皮萨罗在一定程度上缓解了球队上赛季锋线不力的问题，也为他自己赢得了重新证明自己的机会。
在不莱梅获得稳定的主力位置后，皮萨罗又开始了疯狂的表演，他在欧冠小组赛第二轮客场一比一战平国米的比赛中取得进球，在梅阿查球场、在穆里尼奥面前证明了自己。
不莱梅在德甲赛场上历来以神经刀著称，即在打出大比分赢球后，球队在下一场比赛中往往表现低迷，甚至输给一些保级弱旅。皮萨罗回到熟悉的不莱梅，似乎也被这种不莱梅式的风格感染，他也变成了神经刀式的前锋。在德甲第十五轮比赛主场迎战法兰克福的比赛中，皮萨罗将一名优秀前锋应该具备的素质展现得淋漓尽致--左脚得分、右脚得分、抢点、巧射……最终他在那场比赛中上演帽子戏法，帮助球队五比零屠杀对手，也当选该轮最佳球员，但是接下来的比赛他就像是被人施了法术一样，再也找不到任何的状态。
在2011-12赛季中，拜仁慕尼黑再一次四大皆空，并且还获得了颇为耻辱的三亚王称号，而俱乐部也将目光放在了下赛季上，拜仁于德国当地时间5月26日下午，在其官方网站上公布了俱乐部今夏的第四位新援:秘鲁老将皮萨罗在离开拜仁五年之后，重返拜仁。
这一次他重回拜仁也是因为拜仁慕尼黑实在没有更好的选择，他们虽然有不少前锋，但还是缺少真正的中锋，更重要的是他们希望皮萨罗可以做好一个替补，所以这位和张卫一样年轻的球员再次成为了拜仁的队员，但大家都清楚他只是个替补而已。